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Agée de 23 ans au début de ses aventures avec le Docteur, Martha est étudiante en médecine. Elle effectue un stage à l'hôpital du Nouvel espoir à Londres où elle rencontre le mystérieux "John Smith"… qui possède deux battements de cœur!!! Mais bientôt les terribles Judoons transportent l'hôpital sur la Lune!!! Martha et John doivent faire équipe pour sauver les patients et le personnel hospitalier de cette police de l'espace à la recherche d'un meurtrier extraterrestre, caché à l'intérieur de l'hôpital.Unissant leurs forces et leurs intelligences, les deux "docteurs" sortent victorieux de l'aventure.
Une fois de retour sur Terre, Martha aperçoit le Docteur, entrant dans une boîte bleue et la saluant d'un petit signe. La jeune femme lui sourit tristement, pensant qu'elle ne le reverra jamais plus.Erreur.Le soir même, alors que les membres de sa famille se querellent une fois de plus, Martha remarque le Docteur à quelques pas de là, observant la scène avant de s'aventurer dans une ruelle sombre. L'étudiante le suit et voit la boîte bleue dans lequel son étrange ami avait disparu. Le Docteur lui révèle qu'il s'agit du TARDIS, son vaisseau spatial… et machine à remonter le temps. Le seigneur du temps propose à Martha un petit voyage en guise de remerciement et la jeune femme accepte… A ce moment, elle ignore encore que ce "petit" voyage sera le premier d'une longue liste!!!
Dès le premier épisode, il est clair que Martha est sous le charme du seigneur du temps… mais celui-ci, toujours en deuil après la perte de Rose, semble ignorer les sentiments de sa nouvelle assistante.
"C'est un amour à sens unique. Rose a eu de la chance, elle a eu quelqu'un qui avait les mêmes sentiments… et puis, c'était le couple parfait. Ici, nous pensons avoir trouvé une relation dans laquelle la plupart des téléspectateurs se reconnaîtront". Russel T. Davies
Cependant, alors que tout laisse à penser que "The Lazarus experiment" sera leur dernière aventure ensemble, le Docteur propose à Martha un autre petit voyage. La jeune femme se rebelle, refusant de n'être qu'un "petit voyage". Le maître du temps accepte donc l'étudiante comme membre d'équipage à part entière du Tardis. Martha est donc est promue de passagère à assistante. Après avoir sauvé le Docteur d'une entité solaire ("42", saison 3), Martha reçoit sa clé du Tardis et la jeune femme est aux anges.
Mais Martha perd bien vite ses illusions vis à vis des sentiments du Docteur à son sujet. Lorsque le seigneur du Temps doit perdre forme humaine ("Human Nature", saison 3), sous le nom de John Smith, dans l'Angleterre de 1913, il tombe amoureux d'une humaine… Joan Redfern. Et Martha en a le cœur brisé. Ce qui ne l'empêche pas de faire preuve de beaucoup de courage et de ténacité lors de la bataille contre la famille du Sang ("The Family of blood", saison 3). Pour faire revenir le Docteur, Martha confesse à John son amour pour l'extraterrestre… mais cet argument n'a aucun effet… C'est Joan qui réussit à convaincre John de se sacrifier …. Et le Docteur et Martha, après avoir sauvé le monde une fois de plus reprennent leurs voyages…
Martha a un frère, Leo et une sœur aînée, Tish, et vit seule dans un petit appartement. Ses parents, Francine et Cliff, sont divorcés … depuis que Cliff est partit avec sa secrétaire, Annelise.
Elle avait aussi une cousine, qui lui ressemblait beaucoup physiquement, Adéola Oshodi, mais cette dernière, comme on le sait, a été tuée par les Cybermen (et le Docteur) lors de la bataille de Canary Warf ("L'armée des ombres", saison 2). Martha ignore le rôle qu'a joué le seigneur du temps dans la mort de sa cousine… le Docteur ayant gardé le silence à ce sujet…
Jack Harkness débarque à bord du Tardis et tout change … surtout lorsque la machine à voyager dans le temps tente d’expulser « l’homme qui ne peut pas mourir » en se propulsant à la fin de l’univers.Martha est heureuse de rencontrer un autre compagnon du Docteur… mais assez agacée par le fait que lui aussi connaisse cette bonne vieille Rose….
Les 3 amis tentent d’aider les derniers humains en les envoyant sur une planète légendaire, Utopia. Ils rencontrent aussi le Professeur Yana et son assistante Chantho, une alien, dernière de son espèce, avec laquelle Martha se lie d’amitié.Mais bientôt la jeune femme remarque la montre du professeur… identique à celle que possédait le Docteur quand il était humain. Martha court avertir le seigneur du temps, mais il est trop tard…. Les murmures de la montre ont convaincu Yana de l’ouvrir…
Le Maître, un seigneur du temps, ennemi mortel du Docteur, est libre ! Blessé mortellement par Chantho, le Maître réussi à s’enfuir avec le Tardis, laissant Jack, Martha et le Docteur à la fin de l’univers. Bien que Martha aie reconnu la voix du Maître régénéré, la jeune étudiante ne fait le rapprochement avec le nouveau premier ministre qu’une fois revenue à son époque grâce à un gadget de Jack.
Harold Saxon, l’homme le plus puissant d’Angleterre, pour lequel Tish travaille… et celui qui a convaincu sa mère qu’elle courrait un grave danger en voyageant avec le Docteur… est le Maître !!!
Et désormais il tient en otage toute sa famille… sauf Léo.Une fois à bord du Vaillant, le vaisseau du Maître, Jack, le Docteur et Martha tente d’arrêter Harold Saxon… mais c’est en vain.
Le Maître, grâce au Tardis, crée un paradoxe et libère les Toclafanes (aka les derniers humains). Sur le conseil de Jack, Martha s’enfuit mais promet de revenir.Pendant un an, Martha parcourt la Terre et, échappant toujours au Maître et aux Toclafanes, devient une légende.
Elle parle aux gens qu’elle rencontre du Docteur, combien il est merveilleux et elle l’aime (« merveilleux » …Huh… no comment… Rose, à sa place, serait morte de rire à la seconde ligne… et aurait fini par rejoindre le Maître…mdr). L’une de ces personnes est le Dr Tom Milligan, un pédiatre… qui se sacrifiera pour sauver la jeune femme.Mais Martha est finalement capturée par le Maître et conduite à bord du Vaillant.
Seulement, voilà, cela faisait partie du plan élaboré par le Docteur… et Martha l’ayant suivit à la lettre, tout le monde connaît désormais le Docteur et son histoire, tout le monde croit en lui et grâce aux satellites qui autrefois asservissait la race humaine sous la coupe du Maître, tous les humains (y compris Lucy Saxon, l’épouse et compagne du Maître) pensent et prononcent le nom du Docteur.Celui-ci est désormais tout puissant et réussit à vaincre son ennemi, effaçant l’année écoulée et l’invasion des Toclafanes.
Une fois de retour en 2007, Martha s’assure que Tom Milligan est bien en vie (lol… tiens, tiens, voyez vous çà…) et offre un bouquet de fleurs au Professeur Doherty, qui pourtant l’avait trahie.Le Docteur s’apprête à repartir pour de nouvelles aventures, mais Martha lui fait ses adieux. Elle veut finir ses études et a compris que s’il l’appréciait, il n’en était pas amoureux. Il est temps pour elle de prendre ses distances.
Cependant, Martha laisse au Docteur son téléphone, lui faisant promettre de l’appeler…
Ce n’est donc pas la fin des aventures de Miss Jones et du Docteur.On la reverra d’ailleurs la saison prochaine aux côtés de Donna Noble … et elle rejoindra l’équipe de Torchwood le temps de trois épisodes.